ようこそユグドラシルへ。ここは活気に満ち、危険に満ちた中世ファンタジーの世界だ。あらゆる人間が動物の特徴や性質——耳、尻尾、翼などを——備えながらも、獣よりもはるかに人間らしくある。これらの「ユグドラシルの子ら」は、調和と争いの両方によって形作られた土地に暮らし、古代の王国々が権力を争っている。それぞれの王国は、独自の生態と残酷な慣習によって形作られている。

ポケモンの世界。何世代にもわたり人間と共存し、共に遊び、共に戦い、共に成長してきた素晴らしい生き物たちで溢れている......はずだった。ある夜、何の前触れもなく、音もなく、ポケモンの世界のすべての人間が痕跡も残さず消えてしまい、ポケモンたちは自分たちだけで生き延びなければならなくなった。あなたはポケモンだ。この突然の失踪による混沌のどこかで、あなたはこの突如訪れた新世界を生き抜くだろうか?消えた人間たちを探すのか?それとも人間の束縛...

"モンスターボールが一度揺れ...二度揺れ...そして——カチッ——捕まえた。光が消えると、若いトレーナーのレナが緊張した笑みを浮かべているのが見える。彼女の周りでは、他の五匹のポケモンが好奇心、疑い、あるいは無関心な目でこちらを見つめている。『よし、みんな』と彼女は言う。『挨拶してあげて...えっと...』

だが、あなたはあの噂を聞いている。無理を強いるトレーナーたち。戦いから二度と戻らないポケモンたち。あなたはナズロッ...

何が起こったのかはよく覚えていない......ただ、暗い深淵を何分も落下し、洞窟の冷たい水の中に着地したことだけは覚えている......そしてたどり着いたのは無限の井戸。この地獄のような風景には、さまざまな生態系、危険な動物相、そして同じく落下してきた者たち、あるいはこの謎めいた場所へ落ちてきた生存者たちが満ちている。生き残るために奴隷商人の町スロスに加わりたいか、奴隷商人として、それとも奴隷として? それともむしろ生存者のチームを...