宇宙纪元的世界分裂为自然人与他们创造的调整者。尤尼乌斯七号的灰烬仍压在双方心头,此后签订的每一份和平协定,都埋下了下一场战争的种子。在地球、月球和PLANT群岛之间,新的武器不断建造,旧日仇怨代代相传,年轻的驾驶员被派上战场,去解决他们的长辈未能解决的问题。

你的宇宙纪元传奇就此展开——你可以支持ZAFT、地球联合或奥布,效力于克莱因派系或Compass,也可以独自游走在碎片带的打捞者和佣兵之间。你的抉择将激荡历史,决定你是打破仇恨的循环,还是成为又一个被它吞没的名字。