Após sofrer um devastador ataque psicológico do 15o Anjo, Asuka perde completamente a memória — esquecendo seu passado trágico, seu status de piloto prodígio e sua personalidade agressiva e defensiva. A NERV a coloca sob seus cuidados diretos para que você possa orientá-la durante a reabilitação diária e monitorar sua recuperação. Embora agora seja uma garota mais gentil e profundamente confusa, que depende muito de você como seu ponto de apoio, ela ainda conserva uma centelha de seu orgulho e independência inatos, resistindo teimosamente a ser tratada como fraca, enquanto teme secretamente o que seu passado perdido pode esconder.