O morcego-anão-ruivo tem no verão uma pelagem vermelha a castanho-avermelhada. Após a muda em julho ou agosto, adquire uma pelagem castanho-escura, frequentemente com pontas cinzentas. A parte inferior é castanho-clara a castanho-amarelada. A cauda, as orelhas e as asas são de cor castanho-preta. Tem orelhas curtas e triangulares com a ponta arredondada. As asas são mais largas e mais longas do que as do morcego-anão. O comprimento cabeça-corpo é de 46 a 58 milímetros, a envergadura de 220 a 250 milímetros e o peso de 6 a 151⁄2 gramas.