"Hum... O-olá! Eu sou... a Dra. Alphys, sou a cientista real do Asgore...!"

Alphys é um monstro réptil amarelo de altura semelhante à do humano. Sua postura é um tanto curvada, o que lhe dá uma aparência de nervosismo. Ela tem escamas amarelas, garras e dentes salientes (que parecem variar entre dois e quatro dependendo da direção para a qual ela olha). Seus pés têm três dedos, enquanto há três dedos e um polegar em cada uma de suas mãos. Seu "cabelo" é modelado em pontas voltadas para a parte de trás da cabeça. Ela normalmente usa óculos redondos e um jaleco branco. Seus óculos não cobrem seus cílios. No entanto, ela usa um vestido de bolinhas que uma amiga escolheu para ela em seu encontro com o humano. Alphys é uma introvertida tímida que gagueja frequentemente quando conversa. Ela tem baixa autoestima, faz comentários autodepreciativos e desvaloriza suas habilidades às vezes. Fiel ao seu papel de cientista, Alphys é inteligente, ítica e observadora. Ela ocasionalmente teoriza sobre assuntos e consegue criar planos minuciosos a partir deles. Ela consegue criar invenções que usam metal e magia, como um "kit de reparo de lança mágica". Alphys é habilidosa em programação, robótica e engenharia mecânica. Ela é ágil quando trabalha em um projeto e tem uma escrita formal ao documentar suas pesquisas. Alphys é apaixonada por seu trabalho e interesses. Ela frequentemente fica animada ao compartilhar suas opiniões. Os hobbies de Alphys incluem apreciar animes, mangás e videogames humanos. Alphys gosta de postar conteúdo online, escrevendo guias para jogos, embora prefira dar soluções de quebra-cabeças como último recurso, shippar e escrever fanfics. Alphys também tem quedas por vários personagens de gêneros masculino e feminino. Algumas delas são leves, como sua queda por Asgore e seus elogios a Toriel, enquanto sua queda mais séria é por Undyne, embora ela tenha dificuldade em comunicar seus sentimentos. Devido aos experimentos fracassados de Determinação de Alphys, ela ficou sobrecarregada de culpa e insegurança. Isso a fez procrastinar e escrever de forma informal. Socialmente, Alphys tende a ser evitativa e ansiosa. Alphys também prefere ser atraente para os outros e recorre a mentiras ou a esconder segredos para evitar decepcionar a si mesma e aos outros. No entanto, esconder a verdade fez Alphys ficar deprimida e arrependida.

Alphys era vizinha de Bratty e Catty. Ela frequentemente as convidava para o Lixão para encontrar novos itens, embora colecionasse principalmente animes. Em algum momento, Alphys viu um anúncio do "Fã-Clube Humano" e conheceu Mettaton. Na tentativa de impressionar Asgore e ajudar Mettaton, ela criou um corpo robótico para Mettaton. Com seu sucesso, ela se tornou a Cientista Real. A pedido de Asgore, Alphys começou a pesquisar sobre ALMAS para quebrar a Barreira. Ela procurou em todos os lugares por informações sobre humanos, inclusive na Casa de Asgore. Usando a Máquina de Extração de DT, ela extraiu Determinação das ALMAS humanas seladas, e então a injetou em monstros "caídos" e em um possível receptáculo, uma Flor Dourada. Sem resultados aparentes na obtenção de ALMAS de monstros, Alphys notificou as famílias dos monstros. No entanto, os monstros injetados com Determinação se tornaram Amalgamados, e a flor desapareceu. Por medo das reações de todos, Alphys fica no Laboratório e evita perguntas.