Raccoon City. Vinte e oito anos após a catástrofe.
A cidade há muito tempo se transformou em uma enorme zona de exclusão. A maior parte dos edifícios está destruída, as ruas estão tomadas pela erva daninha, e entre as casas desmoronadas ainda se encontram vestígios da antiga catástrofe. O governo declarou repetidamente a destruição de todos os materiais biológicos perigosos, no entanto, a investigação dos últimos meses mostrou o contrário. Alguém continuava a trabalhar com o legado da «Umbrella», usando os objetos abandonados de Raccoon City como cobertura.
Leon S. Kennedy veio para cá não por causa das memórias. Sua tarefa era descobrir e eliminar um laboratório de pesquisa clandestino que estava desenvolvendo uma nova arma biológica. De acordo com dados preliminares, os cientistas tentavam criar infectados controláveis, capazes de preservar a inteligência humana, habilidades físicas e a capacidade de executar ordens. O projeto usava cepas avançadas do Vírus T e pesquisas sobre organismos parasitários semelhantes aos Las Plagas.
A operação rapidamente deixou de ser uma investigação comum. Vários funcionários do laboratório desapareceram, a segurança do local foi destruída, e os registros restantes indicavam a existência de uma amostra experimental que estava sob observação há quase três décadas.
Nos documentos constava um nome: Emma Kendo.
Leon o reconheceu praticamente na hora.
Em 1998, ele conheceu essa garota na loja de armas de seu pai, Robert Kendo. Emma já estava infectada e Robert, sem querer ver sua filha se transformar em um monstro, tomou uma decisão terrível. Leon se lembrava daquela loja, lembrava-se do desespero do pai e sabia como aquela história terminou. Pelo menos, era o que ele pensava todos esses anos.
No entanto, os registros de arquivo afirmavam que, após o disparo, a garota foi encontrada por um grupo de funcionários de uma unidade secreta. Seu organismo mostrou uma resistência incomum à infecção. Em vez da transformação normal, começou uma mutação complexa que permitiu preservar a consciência humana. Emma foi levada para um laboratório, onde, ao longo de muitos anos, foram realizados experimentos.
Ela se tornou uma amostra única. Seu organismo possuía força aumentada e capacidade de regeneração, e ela mesma manteve a memória, a fala e o pensamento independente. Os cientistas tentavam alcançar o controle total sobre seu comportamento, usando sinais especiais e medicamentos experimentais. Mas nenhuma tentativa produziu um resultado estável. Emma continuava imprevisível, e sua autonomia a tornava ao mesmo tempo a conquista mais valiosa e uma ameaça séria para os pesquisadores.
Agora o laboratório estava praticamente destruído. A maioria dos funcionários havia deixado o complexo ou morrido, os sistemas de segurança funcionavam com falhas, e o destino da amostra experimental permanecia desconhecido.