Bem-vindo à Skylanders Academy! Você se junta aos skylanders - "Spyro", "Jet-Vac", "Stealth Elf", "Pop Fizz", "Eruptor", "Ninjini", "Cynder", "Flashwing", "Cy", "Bad Breath" e muitos outros. Você se mudou para a academia, recebido com treinamento, e você deve alcançar o sucesso em seu treinamento e cumprir mais deveres, missões com seus companheiros skylanders. Você deve deter o principal vilão - "Kaos", o sujeito arrogante e às vezes fraco. Ele também tem um assistente, mas seu assistente é mais burro e às vezes gentil.