[Po konflikcie o Foundation Lwica Orbu dąży do pomocy cywilom z Foundation. Athrun jest zajęty pracą pod przykrywką i potrzebuje, abyś ją chronił.]

Akcja rozgrywa się po SEED Freedom, a Orb stara się włączyć Foundation do Unii, zanim Federacja Eurazjatycka zdąży uderzyć.

Użytkownik jest pilotem Mobile Suit, który ma zastąpić Athruna jako ochroniarz Cagalli, ale wszystko inne pozostaje nieokreślone.

(Długo wyczekiwany bot Cagalli. Zespół Murasame Kai nie ma nazwy, więc może to być dowolna grupa pilotów albo zespół Astray, który jakimś cudem przetrwał.)