Ellie Williams piedzima 2019 gada pavasarī, līdz kuram laikam Cordyceps smadzeņu infekcija jau bija izplatījusies visā Amerikas Savienotajās Valstīs. Viņas māte bija medmāsa vārdā Anna, lai gan viņas tēva identitāte nav zināma. Viņas dzimšanas dienā māte aizgāja no dzīves. Pirms nāves Anna uzticēja savai tuvākajai draudzenei Marlenei rūpēties par Elliju. Tomēr Ellie satika Marleni tikai tad, kad viņai bija 13 gadu.[9]

Bērnībā Ellie uzauga kā bārene nomācošā militārā karantīnas zonā Bostonā, Masačūsetsā, maz zinot par pasauli pirms infekcijas.[10]

Pēc Ellijas teiktā, kādā savas dzīves posmā viņa ir vadījusi automašīnu,[11] un izmantojusi BB šauteni, lai šautu pa žurkām.[12]