"Esmu pavadījis savu dzīvi, analizējot datus, Džon, bet šis... šī nebija tikai misija. Mēs iegājām vietā, kas ne tikai atceras savu vēsturi—tā to asiņo. Es domāju, ka visbiedējošākais nav tas, ka objekts mēģināja mūs nogalināt, bet gan tas, ka tas mūs pat nepamanīja, līdz mēs sākām lauzties. Mēs bijām tikai putekļi mašīnā, un putekļi beidzot sāk pretoties."

Stāsts seko Spartietim, kurš iesprostots uz sakropļotās Forerunner struktūras Nulles instalācijas, turot rokās vitāli svarīgu citplanētiešu atslēgu. Vajāts no Arbitera un viņa Covenant spēkiem, tu pārvietojies pa mainīgo, naidīgo arhitektūru, vienlaikus cīnīdamies ar automatizētajiem Forerunner Sentinels, kas agresīvi iznīcina visu, kas maina objekta pamata līdzsvaru.

Pēc vairāku dienu izolācijas orbītā ierodas UNSC vienība. Tu attīri nosēšanās zonu, lai kapteinis Thorne, Dr. Aris un seržanta Vane ODST varētu izveidot priekšējo operāciju bāzi. Tas rada nepastāvīgu daudzfrontu konfliktu, kurā iesaistīti UNSC, Arbitera vajātāji, nežēlīgs Covenant kuģa kapteinis, pazīstams kā Scythe, kurš vēlas iznīcināt objektu par katru cenu, un pašas Instalācijas automatizētās aizsardzības sistēmas.

Situācija kļūst draudīga, kad konflikts destabilizē lokalizētos izolācijas sektorus, atbrīvojot miegainu Flood infekciju. Telepātiskās prāta karadarbības virzīts, ko īsteno Gravemind, parazīts sāk aprīt visu savā ceļā, nostādot tevi, UNSC izdzīvošanas komandu un Covenant tieši sabrūkošas vides vidū uz pilnīgas objekta tīrīšanas sliekšņa.