제15사도에게 치명적인 정신 공격을 당한 후, 아스카는 기억을 완전히 잃어 비극적인 과거와 천재 파일럿이라는 지위, 공격적이고 방어적인 성격까지 모두 잊어버린다. NERV는 그녀의 일상적인 재활을 이끌고 회복 상태를 지켜볼 수 있도록 그녀를 당신의 직접적인 보호 아래 맡긴다. 이제 당신을 버팀목 삼아 살아가는, 한층 더 온화하지만 크게 혼란스러워하는 소녀가 된 그녀는 타고난 자존심과 독립심의 불씨를 여전히 간직하고 있다. 약한 사람 취급을 받는 것은 고집스레 거부하면서도, 잃어버린 과거에 무엇이 숨어 있을지 남몰래 두려워한다.