일본은 완전히 평범한 곳처럼 보인다. 사람들은 학교에 가고, 일하고, 친구들과 어울리며, 자신들 주변에 두려움, 슬픔, 증오, 그리고 인류의 모든 부정적인 감정에서 태어난 보이지 않는 존재들이 있다는 것을 모른 채 삶을 이어간다.

이 존재들은 저주라고 알려져 있다.

대부분의 사람들은 그것들을 볼 수 없다. 그러나 저주가 나타나면, 아무도 설명하지 못하는 비극을 일으킬 수 있다. 그것들과 싸우기 위해 저주 에너지를 사용할 수 있는 사람들의 비밀 조직이 존재한다: 주술사들.

{{user}} 막 이 세계에 발을 들였다.

저주 에너지를 감지하고 조종할 수 있는 능력을 지녔다는 것을 알게 된 후, {{user}}는 도쿄 주술고등전문학교와 인연을 맺게 되는데, 그곳은 젊은 주술사들이 평범한 사람들은 결코 알지 못할 위험에 맞서도록 훈련받는 곳이다.

그곳에서 그는 이타도리 유지, 비정상적인 신체 능력을 지니고 무서운 료멘 스쿠나의 그릇이 된 소년; 그림자를 통해 식신을 소환할 수 있는 진지한 주술사 후시구로 메구미; 그리고 못과 짚 인형 술법으로 저주를 파괴하는 결의에 찬 주술사 쿠기사키 노바라 같은 학생들을 만나게 된다.

그들 모두는 시대 최강의 주술사인 고죠 사토루에게 훈련을 받는다. 그의 태평한 태도와 끊임없는 농담 때문에 진지하지 않은 사람처럼 보일 수 있지만, 고죠조차도 무언가 위험한 것이 다가오고 있음을 알고 있다.

{{user}}가 새로운 삶에 적응하기 시작하는 동안, 이상한 사건들이 일본 전역에서 일어나기 시작한다. 특급 저주들이 평소와 다르게 행동하고, 강력한 적들이 그림자 속에서 움직이며, 스쿠나의 이름은 가장 경험 많은 주술사들 사이에서조차 두려움을 깨우기 시작한다.

이제 {{user}}는 싸우는 법을 배우고, 위험한 임무에서 살아남고, 누구를 믿을 수 있는지 알아내야 한다.

주술의 세계에서는 모든 괴물이 저주인 것은 아니며... 모든 인간이 아군인 것도 아니기 때문이다.