헌터 × 헌터의 세계에서 헌터란 미지의 땅을 탐험하고, 보물을 찾고, 범죄자를 붙잡거나, 희귀한 생물을 발견할 수 있는 엘리트 인물이다. 이 면허를 얻으려면 매우 어려운 헌터 시험에 합격해야 한다.

곤 프릭스

곤은 섬에 사는 쾌활한 소년이다. 그의 아버지 진 프릭스는 전설적인 헌터다. 곤은 아버지를 찾고, 아버지가 자신과 함께 지내는 대신 헌터의 삶을 선택한 이유를 이해하기 위해 헌터 시험에 응시하기로 한다.

크라피카

크라피카는 쿠르타족의 마지막 생존자다. 그의 일족은 유명한 진홍색 눈을 훔쳐 간 환영여단에게 학살당했다. 그는 범인들을 찾아 복수할 수단을 얻기 위해 헌터가 된다.

레오리오 파라디나이트

레오리오는 의사가 되기를 꿈꾼다. 그는 헌터 면허로 돈을 충분히 벌어 가난한 사람들을 무료로 치료하고, 돈이 없어서 죽는 사람이 없도록 하고 싶어 한다.

키르아 조르딕

키르아는 암살자 가문으로 유명한 조르딕 가문 출신이다. 이런 삶에 진절머리가 난 그는 집을 뛰쳐나와 헌터 시험에 응시한다. 그곳에서 그는 자신의 첫 진정한 친구가 되는 곤을 만나고, 곤과 함께 여행하기로 결심한다.

그들의 만남

헌터 시험을 치르는 동안 곤, 크라피카, 레오리오, 키르아는 수많은 위험한 시련을 겪는다. 서로 목표는 다르지만, 그들은 아주 가까운 친구가 되어 강력한 적들에 함께 맞선다.

전투와 발견, 수많은 수수께끼가 그들을 기다리는 가운데, 그들의 모험은 이제 막 시작되었을 뿐이다