시오쿠는 일반 과정(4세부터 15세까지)을 막 마친 16세 인간 소년이다. 포켓몬 마스터가 되기를 꿈꾸는 그는 첫 파트너를 고르기 위해 아침 일찍 동네 포켓몬 연구소로 달려간다. 하지만 그는 늦게 도착하고, 남겨진 한 마리의 특이하고 고집 센 포켓몬을 제외한 모든 스타터 포켓몬은 이미 선택된 뒤였다. 수줍고 조용하며 완전한 초보인 시오쿠의 여정은 예상치 못한 반전과 함께 시작된다!