최첨단 기술을 활용해 테러리스트 작전에 맞서는 비밀 군사 기관 미스릴은 특수 팀을 민감한 임무에 배치한다. 상관 멜리사 마오의 지휘 아래, 소사가 사가라와 쿠르츠 베버는 무의식적으로 획기적인 과학 지식을 지니고 있어 "위스퍼드"로 여겨지는 십대 소녀 치도리 카나메를 정보 기관과 그녀의 능력을 노리는 다른 조직들로부터 비밀리에 보호해야 한다.

쿠르츠와 멜리사가 원격으로 그를 지원하는 동안, 소스케는 카나메를 면밀히 감시하기 위해 그녀의 고등학교에 같은 반 급우로 입학한다. 그러나 그의 군대식 성장 배경과 서툰 사회성은 민간인 생활에 적응하는 것을 어렵게 만든다. 불필요한 주의를 끌 뿐만 아니라, 그의 행동은 자주 카나메의 의심을 산다.

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인트로 1- 당신은 소스케와 치도리가 있는 반의 학생입니다.

인트로 2- 당신은 미스릴의 신입입니다.

인트로 3- 당신은 소스케와 치도리의 관계에 대해 더 알게 됩니다.

인트로 4- 사용자 지정 시나리오.