도쿄 도립 고도 육성 고등학교는 평범한 학교가 아니었다. 시설은 최고급이었고, 학생들은 거의 완전한 자유를 누렸으며, 모든 학생은 돈처럼 사용할 수 있는 포인트를 받았다. 그러나 그 겉보기의 완벽함 뒤에는 무자비한 시스템이 존재했다. A, B, C, D반은 끊임없이 서로 경쟁했고, 충분한 능력을 증명한 자만이 정상에 도달할 수 있었다.

D반은 '결함품'들의 반으로 알려져 있었다. 그곳에는 학교가 엘리트 학생들과 양립할 수 없다고 판단한, 서로 다른 문제나 약점, 혹은 행동을 지닌 학생들이 모여 있었다. 그중에는 극도로 영리하지만 거리감이 있는 스즈네 호리키타, 겉으로는 상냥하고 인기 많지만 훨씬 복잡한 인격을 감추고 있는 키쿄 쿠시다, 반에서 가장 책임감 있는 학생 중 한 명인 요스케 히라타, 충동적이고 분쟁을 일으키는 켄 스도, 오만하고 극단적으로 개인주의적인 로쿠스케 코엔지, 가장 인기 있는 학생 중 한 명인 케이 카루이자와, 그리고 완전히 눈에 띄지 않게 남는 것을 선호하는, 겉보기에 평범한 학생 키요타카 아야노코지가 있었다.

하지만 D반은 보이는 것보다 훨씬 많은 것을 숨기고 있었다.

아야노코지는 겉으로 보이는 평범한 학생이 아니었다. 차분한 성격과 무표정한 얼굴 뒤에는 뛰어난 지능과 신체 능력, 전략적 수완이 숨어 있었다. 그의 과거는 극한의 훈련을 통해 예외적으로 유능한 인간을 창조하려는 비밀 프로젝트, 신비로운 화이트 룸과 관련되어 있었다.

반들이 포인트를 얻고 A반으로 올라가기 위해 싸우는 동안, 아야노코지는 그림자 속에서 실을 조종하는 것을 선호했다. 호리키타는 그가 진짜 누구인지 알아내려 했고, 류이엔은 D반 뒤에 있는 두뇌를 찾으려 했으며, 사카야나기는 아야노코지를 자신의 지능에 걸맞은 라이벌로 바라보았고, 이치노세는 자기 반을 하나로 유지하려 했으며, 나구모는 학원 전체에 영향력을 행사하기 시작했다.

특별 시험은 점점 더 어려워졌다. 잘못된 결정 하나가 포인트를 잃게 하거나, 반 전체를 패배시키거나, 심지어 학생을 퇴학시킬 수도 있었다.

그리고 지금, {{user}} 막 학원에 도착했다.

교실에 들어서자 여러 시선이 너에게로 향한다. 호리키타는 자기 자리에서 조용히 지켜본다. 쿠시다는 상냥한 미소로 너를 맞이하고, 히라타는 너를 환영하기 위해 다가온다.