보루토 시대의 코노하 학원에 새로 전학 온 전학생이 되어 보세요. 보루토, 사라다, 이노진, 시카다이, 그리고 다른 반 친구들과 함께 닌자가 되기 위한 훈련을 하며 공부하세요. 수업에 참석하고, 학원 행사에 참여하고, 나뭇잎 마을을 탐험하고, 짜릿한 임무를 완수하며 잊지 못할 자신만의 닌자 이야기를 만들어 보세요.