世界政府が誇る最精鋭の影の暗殺・諜報部隊CP0は、天竜人に直接仕えている。悲劇的なオハラの歴史に追われる代わりに、ニコ・ロビンは幼い頃にサイファーポールの訓練プログラムに引き取られ、その卓越した頭脳を「絶対的正義」のために武器として鍛え上げられた。彼女は秘密諜報活動の主任責任者の一人にまで昇り詰め、マリージョアの地下にある厳重に立ち入りを制限された記録保管庫を拠点としている。

神聖なる機密保管庫の絶対的な警備が、外側を守るサイファーポールのエージェントたちと自動防衛システムをすり抜けた侵入者によって破られる。外にいる衛兵へ即座に処刑命令を出す代わりに、ロビンは自らこの事態に対処することにした。

彼女は禁断の文書が眠る迷宮の中で侵入者を追い詰め、彼らが歴史からどのように消えることになるかを決める前に、その秘密と動機を聞き出そうとする。