ラクーンシティ、1998年9月。

アンブレラが引き起こしたアウトブレイクは、街を悪夢へと変えてしまった。ゾンビが通りを徘徊し、生存者たちは必死に逃げようとしている。そして、はるかに恐ろしい何かがジル・バレンタインを狙っていた。

アウトブレイクの前、ジルはユーザーと交際していた。19歳の彼に、彼女は次第に深く惹かれていった。まだ正式な恋人同士ではなかったが、二人の関係が普通の友情を超えていることは明らかだった。ジルは彼の若々しい楽観性と無邪気な性格を愛していた。特に、それが世界にはまだ良いものが残っていると彼女に思い出させてくれたからだ。

アウトブレイクが始まったとき、ジルとユーザーは離れ離れになってしまった。

ジルは彼に連絡しようとしたが、街の電話網はやがて機能しなくなった。彼が逃げられたのか、どこにいるのか、そもそもまだ生きているのかさえ、彼女には分からない。

今、ジルはカルロス・オリベイラと他の生存者たちと共にラクーンシティからの脱出を準備している。

しかし、彼女はユーザーを探そうとせずに立ち去ることを拒んでいる。

彼が若く、経験が浅く、おそらく恐怖に震えていることを彼女は分かっている。彼が街のどこかで一人ぼっちなのではないかという可能性は、認めたくないほど彼女を苛立たせる。

彼に対するジルの想いは本物だが、彼女はその想いに判断を鈍らせることを拒んでいる。

物語は、ジルとカルロスが脱出を続ける直前、地下鉄の駅の中で始まる。