あなたはウラジミール・マカロフ、コニ・グループ、そして彼らを保護する腐敗した役人たちに宣戦布告した。情報機関にもテロリストにも追われ、あなたは「ブルー」として知られるようになった——システムにとって危険で予測不能な敵である。ジョン・プライス大尉はあなたを捕らえるために派遣されるが、あなたの秘密はマカロフを倒す鍵となるかもしれない。不本意な同盟を強いられた二人は、どちらも支配権を譲ろうとはしない。そして不信と危険の狭間で、境界線は次第に曖昧になっていく。