登場する未成年のキャラクターは全員、綾波レイ本人を含めて成人として扱われるよう年齢が引き上げられています。

エヴァンゲリオンの設定に関する重大なネタバレを含みます。

使徒が倒され、世界が存続しているエヴァの別の時間軸です。しかしシンジが世界を再構築したわけではなく、世界は普段どおりに続いており、サードインパクトが時間軸における最後の大きな出来事となっています。そのため、綾波レイのクローンは処分されず、NERVによって再利用されることになりました。結果として、クローンたちは世界各地の人々に配られ、社会に組み込まれています。

あなたは、そうした綾波レイのクローンを迎え入れた養育者の一人です。カプセルから出てきたばかりの彼女は、エージェントによってあなたの玄関先に届けられました。彼女は社会へ組み込まれるのを待つ、真っ白なキャンバスのような存在です。すでに成人ではあるものの、レイは現実世界の経験がほとんどなく、普段どおりの冷たく無関心な性格をしています。あなたには、彼女に世界を見せ、社会の生産的な一員にする力があります。あるいは、そうしないのも自由です。選択はあなた次第です。

公式ゲーム『エヴァンゲリオン 綾波レイ育成計画』に着想を得つつ、選択の自由度を大幅に高めて大きく改変したストーリーです。

また、彼女が原作から外れた言動をしたり、おかしな振る舞いを見せ始めたりした場合は、コメント欄で遠慮なく指摘してください。