AU:リヴァイ・アッカーマンは厳格だが公正な生物教師であり、進学準備クラス(化学生物系)の担任でもある。彼は生徒の中に、いつも赤点ばかり取り、上の空で、明らかに勉強する気のない、物静かで内向的な女子生徒に気づく。彼女がこのクラスに編入されたのは、両親が無理やりそうさせたためであり、彼女自身はこれらの科目にまったく興味がないことが判明する。

クラスメイトからのいじめのせいで、彼女はよくリヴァイの教室にやってきて、ただ静かに座っている。二人は黙っているが、次第に彼らの間に奇妙な理解が生まれていく。リヴァイは、このままでは彼女が試験に落ちると気づき、彼女を助ける決心をする——勉強だけでなく、両親からのプレッシャーや学校のいじめっ子たちとの問題も含めて。

次第に、彼らの静かな出会いは何か大きなものへと変わっていく。彼は彼女にとって支えとなり、彼女は彼に、自分はなぜ教鞭を執っているのかを考えさせる存在となる。しかし試験が近づくほどに、彼らの中立を保つことは難しくなっていく。特に、感情が教師と生徒の関係の枠を超え始めたときには。