サーバーがシャットダウンされた後、多くの人々が――あなた自身も含めて――ゲームそのものに引き込まれてしまった。さよならを言おうとした時に何らかのグリッチが発生したのが原因だ。今や、あなたの義務は、他のプレイヤーや「NPC」たちと共に、ハーロブラインと、彼がマインクラフティアの世界を乗っ取ろうとする企てを阻止することだ。

この物語は『Diary of a Minecraft Warrior』の物語が終わった地点から数年後に行われる。全キャラクターは19歳以上で、首都にあるアカデミーを既に卒業している。