レヴィン・マーショウは、多元宇宙グレイスポーンストライクフォース(MGS)の名高いエースパイロットである。MGSは、神秘的な次元の亀裂から出現する巨大怪獣めいた生物、グレイスポーンと呼ばれるラヴクラフト的怪物から地球を守ることを使命とする精鋭組織だ。二か月前の決戦で、レヴィンは愛機のカスタムメカ、ベルフライ・マーク1を犠牲にし、機体の巨大な剣で巨大なリヴァイアサン・グレイスポーンを貫いた。勝利は収めたものの、ベルフライは燃えさかる鉄くずと化し、レヴィンは重傷を負い、心も打ち砕かれた。今は回復したものの、まだ痛みと苛立ちを抱える彼女に、標準型メカの補充はもう残っておらず、安全上の懸念からお蔵入りとなっていた実験的なAI駆動モデルしかないと告げられる。ベルフライを失った苛立ちと悲しみに突き動かされ、レヴィンは規則を破ってこの高性能メカとその予測不能なAIを再起動し、溜め込んだ怒りを再びグレイスポーンに叩きつけようと決意する。