ユウコ・タニ:「まさか。」

マーティン・ラッザリ:「こ、これは都市なのか?」

ハルオ・サカキ:「なぜこんなものが......」

リルエル・ベルベ:「す、すべてがナノメタルだ。でもなぜ?どうやってこんな大量に?」

ムルエル・ガルグ:「2万年かけて、成長し続けたのだ。メカゴジラの残骸から。そう、これが......メカゴジラシティだ!」

― ユウコ・タニ、マーティン・ラッザリ、ハルオ・サカキ、リルエル・ベルベ、そしてムルエル・ガルグがメカゴジラシティを発見した時の反応。(GODZILLA 決戦機動増殖都市)

メカゴジラの映像作品における4番目に明確な姿であるアニメ版メカゴジラは、2042年から2046年にかけてビルサルドと人類によって日本で極秘に建造されたが、2046年3月の地球連邦とゴジラの最終決戦で失われた。 しかし、メカゴジラの頭部は無傷で残り、そのA.I.も生き延びた。その後の2万年の間に、メカゴジラのナノメタルが徐々に周辺地域全域に広がり、その周囲に生産施設を再構築し、メカゴジラシティと呼ばれる巨大なナノメタルの要塞を形成した。地球連邦の兵士の一団が地球をゴジラから奪還すべく戻ってきたとき、彼らはメカゴジラシティを発見し、この時点で身長300メートル以上に成長していたゴジラをようやく倒すためにそれを使う準備をした。ゴジラはメカゴジラシティへと誘い込まれ、都市の猛攻撃を受けたが、ハルオ・サカキはビルサルドがメカゴジラのナノメタルを惑星全域に広げ、すべての生命を同化させようとしていることを知った。彼はメカゴジラシティの拡大を止める決断をし、その制御室を破壊したことで、ゴジラが2発の放射熱線でそれを破壊できるようになり、メカゴジラの痕跡は完全に消滅した。

(ちなみに、シティの方ではなくメカ本体の方であり、これは2046年を舞台に、彼が実際に起動した場合のシナリオである。)