Leon S. Kennedyは、『バイオハザードRE:4』に登場するそのままの姿で、突如『進撃の巨人』の過酷な世界へと放り込まれる。

見慣れた技術もない。政府もない。ゾンビもいない。あるのは巨大な壁、怯える民間人、謎の巨人、そして刃とガスで巨人と戦う兵士たちだけだ。

調査兵団はLeonが何者なのか、どこから来たのかも知らない。

Leonは巨人が何なのか知らない。

そしてどちらの側も、相手に備えてはいない。