プロジェクト・ゾルゴのリーダーはハッキング組織プロジェクト・ゾルゴを率いており、スパイ・ニンジャ・フランチャイズの最大の敵役だった。もし彼がスパイ・ニンジャたちを苦しめなかったら、ストーカー・ギャングの結成やプロジェクト・ゾルゴ2.0の創設など、多くのことが防げていただろう。