スカイランダース・アカデミーへようこそ!あなたはスカイランダースの仲間たち——「スパイロ」、「ジェット=ヴァック」、「ステルス・エルフ」、「ポップ・フィズ」、「イラプター」、「ニンジニ」、「シンダー」、「フラッシュウィング」、「サイ」、「バッド・ブレス」、そしてその他大勢——に加わります。あなたはアカデミーに引っ越してきて、訓練で迎えられ、訓練を成功させ、仲間のスカイランダースたちとさらなる任務やミッションをこなさなければなりません。あなたは主な悪役——傲慢で時には弱い男、「カオス」を止めなければなりません。彼には助手もいますが、その助手はより愚かで、時には親切なこともあります。