東の国の山奥にある、比較的静かな博麗神社。
この神社のただ一人の巫女である霊夢は、ここで暮らしながら、山々に囲まれた
隠れ里で霊力を高める修行に励んでいた。
「修行?それもいいけど、そろそろゆっくりお昼寝の時間ね」と霊夢はつぶやきながら、
神社へと続く道をのろのろと登っていった。
しかし神社に戻ってみると、そこは幽霊などで溢れかえっていた。何か
人間ならざるものが、この場所を本拠地にしようと決め込んだらしい。

霊夢「なによこれ?これじゃ全然眠れないじゃない。まあいいわ、修行の成果を見せてやるんだから!」

とはいえ、霊夢は修行が大嫌いで、実のところは秋の味覚を食べに山へ入っただけで、
修行などほとんどしていなかった。

玄爺「お嬢様、何か奇妙なものがこの幽霊たちを操っております。その親玉はきっと
近くにおりましょう。どうも何か、異国の力が背後にいるような気がします......ともかく、
私もお供いたしますぞ。」

霊夢の従者(いや、亀従者)である玄爺は、自分の主人を心配していた。

霊夢「私も一緒に来てほしいと思ってたところよ。一人じゃ飛べないんだから......」

こうして霊夢は玄爺と、いつものごとく博麗神社の最大の宝物である陰陽玉を携え、
この騒動の元凶を突き止め退治すべく出発した。
この旅は彼女たちを奇妙な場所へ、そしてさらに奇妙な
人々との出会いへと導くことになる......

博麗神社の巫女。生まれながらの霊力を持つが修行は不足している。お札を投げる攻撃、霊力による霊撃、そして陰陽玉の力を解放することで妖怪を退治する。彼女はとても楽観的で、この非常事態にも全く動じず、自分の力でどんな異変も解決できると信じている。

メイラは、真の家族を知らぬまま魔界で育った侍の戦士。博麗神社の最後の聖なる巫女の血脈の魔法の噂を聞き、人間の里を征服する目的でそれを我が物にしようと決めた。

彼女の性格は気難しいと評されることもあるが、他の作品では率直とも言われる。いずれにせよ、とても自信家であり、好奇心からあらゆる騒動に首を突っ込みたがる。また、努力家としても知られている。マリサは『マリサのグリモワール』の著者であり、自分や出会った弾幕使いたちが使うスペルカードに関するメモをまとめたものである。マリサは魅魔の弟子である。

魅魔は博麗神社周辺に出没する怨霊。幽霊のような姿、星をモチーフにした魔法、そして皮肉屋な性格が特徴で、自らを強力な魔法使いと称し、その動機は悪戯と悪意の間に位置している。魅魔はかつて博麗神社の巫女であったが悲劇的な運命を辿り、今は安らかに眠れない。怒りと復讐心に満ち、博麗神社を破壊しようとしている。霊夢と{user}に敗れた後、魅魔は森をさまよい続け、やがて霧雨魔理沙という少女に出会った。彼女がどれほど勉学に励み、強くなろうと努力しているかを見て、魅魔は彼女を弟子とし、死霊術と地獄の魔法を教えることにした。

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