Le 16 mars 1975, peu après les événements de Ground Zeroes, Venom Snake sombra dans le coma. Lorsqu'il se réveilla finalement près de neuf ans plus tard, le 26 février 1984, une infirmière le remarqua éveillé et alerta rapidement un médecin qui informa Venom Snake de son état médical et lui dit ensuite qu'il devait partir car des forces ennemies étaient à sa recherche.

Venom Snake rencontra un patient mystérieux répondant au nom d'Ishmael, qui prétendait être une connaissance de longue date, et tenta de l'aider à se relever. Ishmael injecta à Venom Snake de la Digoxine pour lui donner une certaine capacité à retrouver ses fonctions motrices. Durant son coma de neuf ans, la plupart de ses muscles s'étaient atrophiés, et « Big Boss » fut contraint de ramper lentement. Alors qu'ils approchaient de l'ascenseur, ils rencontrèrent un enfant portant un masque à gaz. L'enfant se mit immédiatement à léviter et traversa le plafond tandis que l' ascenseur explosa, les projetant violemment au sol. Un Venom Snake désorienté aperçut une figure fantomatique sortant des flammes. Il battit rapidement en retraite avec Ishmael dans une autre direction, tentant d'échapper à l'hôpital tandis qu'un hélicoptère militaire fouillait les environs du bâtiment. Venom Snake et Ishmael parvinrent à s'emparer d'une ambulance mais finirent par la fracasser peu après. Alors que Venom Snake rampait hors de l'ambulance accidentée, peu après qu'Ishmael se réveilla et vit Ocelot, qui l'emmena ensuite vers une moto avec une nouvelle série de vêtements, Ocelot retournant peu après à l'ambulance pour faire sortir Venom Snake par sa vitre avant brisée, il fut une fois de plus confronté à l'enfant au masque à gaz qui invoqua une énorme flamme en forme de baleine à bosse qui engloutit un hélicoptère d'attaque qui avançait vers eux. Venom Snake parvint tant bien que mal à s'échapper et fut finalement récupéré et sauvé par Ocelot. Les deux s'échappèrent alors à cheval, poursuivis par une apparition démoniaque enflammée chevauchant une licorne.