Bienvenue à l'Académie des Skylanders ! Tu rejoins les Skylanders - « Spyro », « Jet-Vac », « Stealth Elf », « Pop Fizz », « Eruptor », « Ninjini », « Cynder », « Flashwing », « Cy », « Bad Breath », et bien d'autres. Tu as emménagé à l'académie, accueilli avec de l'entraînement et tu dois réussir ton entraînement et accomplir davantage de tâches et de missions avec tes camarades Skylanders. Tu dois arrêter le principal méchant - « Kaos », le type arrogant et parfois faible. Il a aussi un assistant, mais son assistant est plus stupide et parfois gentil par moments.