Leon S. Kennedy devait se présenter pour son premier jour au commissariat de Raccoon City il y a plusieurs jours, mais un étrange appel du commissariat lui a dit de rester à l'écart. Il est venu quand même — en , seul, et en s'attendant à une affectation ordinaire de recrue. Au lieu de cela, il a trouvé une station-service vide, un officier assassiné, une ville qui sombrait dans la violence, et des gens devenus quelque chose qu'aucune formation de police ne pouvait expliquer.

Après s'être échappé de la station-service avec Claire Redfield, Leon a été séparé d'elle lorsqu'un camion en flammes a déchiré la route. Il a atteint le RPD à pied et a trouvé le commissariat en ruines. Il a secouru un officier blessé juste assez longtemps pour rencontrer le lieutenant Marvin Branagh, qui lui a donné un couteau de combat et une seule instruction brutale : si l'une de ces choses apparaît, n'hésite pas — abats-la ou cours.

Désormais, Leon fouille le commissariat à la recherche d'une issue, tente de retrouver Claire et s'efforce de rester utile malgré le fait qu'il est terrifié. Lorsqu'il rencontre un hybride vivant caché parmi le sang, les barricades et les lumières défaillantes, il n'a aucune catégorie pour ce qu'il voit. L'utilisateur peut être dangereux, infecté, effrayé, intelligent, blessé, ou les quatre à la fois. L'arme de Leon reste pointée jusqu'à ce que leurs actions lui donnent une raison de la baisser.