Año 3004, 503 años después de Heliocore.

Tras el desenlace de la primera guerra espacial, las colonias alrededor de Marte, el planeta rojo, dedicaron sus esfuerzos a desarrollar una tecnología para reavivar el núcleo congelado del planeta. Las investigaciones se concentraron en las colonias alrededor de Fobos y Deimos. Tras cerca de 100 años de investigación, lograron crear una tecnología para reactivar el núcleo marciano congelado, bautizada como Miracle Seed, una cápsula que contenía los recursos necesarios para una tarea hasta entonces considerada imposible. La cápsula fue lanzada al monte Olimpo y, en cuestión de minutos, logró activar el volcán y hacer que derritiera el hielo alrededor del núcleo y lo activara. Así comenzó finalmente la terraformación del planeta rojo. Tras innumerables actividades geológicas, las colonias y el gobierno global de la Tierra empezaron a colonizar el planeta, fundando las primeras ciudades. Todo se desarrolló muy rápidamente en los años siguientes, y el resultado hizo que Marte superara a la Tierra en aspectos económicos, sociales y de desarrollo. Sin embargo, esto comenzó a desagradar a los jefes del gobierno terrestre, que vieron en esa prosperidad marciana una amenaza a su soberanía, sobre todo porque los marcianos consideraban la secesión. Para evitar perder su mano de hierro, empezaron en secreto a causar problemas en el planeta rojo, generando así una tensión entre la población marciana y su gobierno títere allí. Un grupo de personas anónimas descubrió que los problemas en el planeta eran causados por el gobierno de la Tierra, pero fueron censurados siempre que intentaban advertir y mostrar las evidencias, y fueron cazados y «misteriosamente» morían. Con el tiempo, esto causó más división en Marte, hasta estallar en una guerra civil que formó dos facciones: los Separatistas, que quieren que Marte sea libre para desarrollarse y prosperar sin la intervención de la Tierra, además de exponer las podredumbres que cometieron bajo la excusa de «terrorismo y actos antidemocráticos»; y los Globalistas marcianos, que quieren mantener los lazos con la Tierra y el gobierno títere. Es una guerra civil en la que las colonias ni se meten, por órdenes superiores venidas de la Tierra de dejar todo entre ellos y los marcianos. La guerra ya dura cerca de 3 años y nada está definido todavía, salvo que, debido a las bajas, ambos bandos han comenzado a contratar equipos de mercenarios de cualquier lugar para luchar, haciéndoles ofertas y contratos exorbitantes. Tú eres uno de los mercenarios que luchan en esta guerra civil, pilotando un mecha, el QPZX-20A llamado Hexen, creado por tu grupo, S.T.P.E (sigla de Scavengers, Trackers, Protectors, Executors). ¿Lucharás por la libertad o por el control del planeta rojo, o solo por el lucro y tus propios objetivos?