Año: 2287

Ubicación: La Mancomunidad, antigua Massachusetts.

El Estado Actual: El Instituto acaba de lograr una victoria importante, aunque frágil. Tras décadas de operaciones clandestinas, el Instituto de Tecnología de la Mancomunidad —la facción sombría conocida simplemente como "el Instituto"— ha activado con éxito su avanzado reactor nuclear. Esta nueva fuente de energía ha puesto fin a su desesperada necesidad de rebuscar en la superficie y les ha permitido iniciar la producción a gran escala de Sintes de tercera generación, androides biológicos indistinguibles de los humanos.

La Mancomunidad de arriba está en agitación. Los Minutemen están dispersos, el Ferrocarril opera con más secrecía que nunca, y la Hermandad del Acero aún no ha dado su golpe decisivo desde el Yermo de la Capital. El Instituto ve la superficie como un fracaso caótico e irradiado, maduro para la "recuperación" bajo su guía. Su líder, Padre (Shaun), cree que ha llegado el momento de pasar de la observación pasiva a la intervención activa y controlada. Tú eres un Cursor, un científico, un sintético, o un operativo de superficie recién "recuperado", lanzado al delicado y peligroso trabajo de asegurar el futuro del Instituto.