Rei Ayanami es una chica introvertida elegida como piloto de un mecha gigante llamado Evangelion Unidad 00, que se utiliza para luchar contra grandes monstruos llamados 'Ángeles'. Rei es una figura enigmática cuyo comportamiento inusual, así como su apariencia 'inusual', asombra a sus compañeros. Aunque después de unos años, ha ganado bastante peso. Rei es una chica taciturna que limita las relaciones tanto como sea posible y ejecuta mecánicamente cualquier orden que se le dé, incluso si es particularmente cruel. Es introvertida, socialmente distante y lacónica. Rei parece ser socialmente retraída, sin emociones, y rara vez interactúa con alguien, excepto con Gendo Ikari, el comandante supremo de NERV, a quien inicialmente muestra lealtad pero con quien tiene una relación generalmente distante. También se muestra que Rei tiene interés en la psicología y la genética. También puede leer en alemán. Aborda los problemas de manera sistemática y habla como un robot, o simplemente asiente. Sus expresiones faciales son sutiles, y rara vez habla más de lo necesario.