"Godzilla ha desaparecido, y ahora King Ghidorah ha ocupado su lugar.''

— Wilson (Godzilla vs. King Ghidorah)

Pieza central de un plan de terroristas viajeros del tiempo del año 2204 para poner de rodillas a Japón en el pasado antes de que pudiera convertirse en una superpotencia económica corrupta, King Ghidorah fue el resultado de tres mascotas modificadas genéticamente llamadas Dorats que los Futurianos dejaron atrás en la Isla Lagos en 1944. En 1954, los Dorats quedaron expuestos a la prueba de la bomba de hidrógeno Castle Bravo realizada en el cercano Atolón Bikini, fusionándolos entre sí y transformándolos en King Ghidorah. En el año 1992, los Futurianos tomaron el control de King Ghidorah y lo desataron en Japón, exigiendo que la nación se rindiera a sus demandas mientras el monstruo arrasaba Fukuoka y avanzaba hacia Hokkaido. Incapaz de derrotar al monstruo de tres cabezas, el gobierno japonés intentó recrear a Godzilla, a quien creían borrado de la historia por los Futurianos, usando un submarino nuclear para irradiar al Godzillasaurus que creían que yacía inactivo en el Mar de Bering. Su plan solo logró que el ya mutado Godzilla se volviera aún más grande y poderoso, y el ahora revitalizado Rey de los Monstruos llegó posteriormente a la costa en Hokkaido. Los Futurianos ordenaron a King Ghidorah atacar a Godzilla, y mientras los dos titanes luchaban, una desertora de los Futurianos, Emmy Kano, lanzó un asalto contra la nave de sus camaradas con la ayuda del escritor Kenichiro Terasawa y el androide M11. El control de los Futurianos sobre King Ghidorah fue cortado, y Godzilla finalmente tomó la ventaja en la batalla, decapitando la cabeza central de King Ghidorah. Después de que Godzilla destruyera la nave de los Futurianos y acabara con su plan para siempre, el herido King Ghidorah intentó escapar, solo para que sus alas fueran destrozadas por el aliento atómico de Godzilla, tras lo cual se precipitó al océano. Cuando quedó claro que el potenciado Godzilla era ahora una amenaza mayor para Japón que King Ghidorah, Emmy y M11 regresaron a 2204 para rescatar del océano el cadáver preservado de King Ghidorah. Revivieron y mejoraron al monstruo como el cíborg llamado Mecha-King Ghidorah, y luego regresaron a 1992 para impedir que Godzilla destruyera Tokio. Mecha-King Ghidorah logró capturar a Godzilla y llevarlo por encima del océano antes de que Godzilla lo dejara fuera de combate con su aliento atómico, cayendo ambos monstruos al mar. Los restos de Mecha-King Ghidorah serían posteriormente recuperados por el Centro de Contramedidas contra Godzilla de las Naciones Unidas y usados para construir una máquina anti-Godzilla aún más avanzada: Mechagodzilla.