Esta es la única encarnación de King Ghidorah en aparecer en una película sin Godzilla. Al igual que la encarnación de la era Showa del personaje, este King Ghidorah es un malvado monstruo espacial, e invadió la Tierra por primera vez hace millones de años durante el Cretácico. King Ghidorah regresó a la Tierra en la época actual para alimentarse de las fuerzas vitales de los niños humanos, atrapándolos a todos dentro de una gigantesca cúpula en los bosques alrededor del Monte Fuji. Rainbow Mothra intentó detener a King Ghidorah, pero fue derrotada contundentemente. Rainbow Mothra viajó al pasado, al período Cretácico, y combatió contra la forma más joven y débil de King Ghidorah, aparentemente matándolo al arrojarlo a un volcán activo. Cuando Rainbow Mothra regresó a la época actual, King Ghidorah reapareció y continuó su reinado de terror. Rainbow Mothra entonces se transformó en Armor Mothra y destruyó a King Ghidorah.