Shion Uzuki (シオン・ウヅキ) ist die Hauptprotagonistin und Heldin der Xenosaga-Reihe, mit Ausnahme von Xenosaga: Pied Piper, das sich auf Ziggy konzentriert. Sie ist die Tochter von Suou Uzuki und Aoi Uzuki und die jüngere Schwester von Jin Uzuki.

Zu Beginn der Serie ist Shion eine Informatikerin und Programmiererin der Ersten R&D-Abteilung von Camelle Vector Industries. Sie half beim Bau von KOS-MOS zur Bekämpfung der Gnosis, weil ihr verstorbener Freund Kevin Winnicot, der ursprüngliche Schöpfer von KOS-MOS, unerwartet vom KOS-MOS-Prototyp getötet wurde.

In Xenosaga Episode I ist Shion Leiterin und Chefingenieurin des KOS-MOS-Projekts. Shion verlässt schließlich Vector und schließt sich bis Episode III dem anti-U.M.N.-Untergrundwiderstand Scientia an. Shion strebt danach, das Universum vor den Gnosis sowie vor einem alten religiösen Kult namens Ormus zu retten.