Der Klonuntergrund war ein unterirdisches Widerstandsnetzwerk, das gegen das neu gegründete Galaktische Imperium kämpfte, mit dem Hauptziel, alle desillusionierten Klonkrieger, die aus dessen Reihen desertieren wollten, zu befreien und zu beherbergen. Gegründet vom ehemaligen Klonkapitän Rex im Jahr 19 VSY, operierte der Klonuntergrund vom Wilden Raum -Planeten Teth aus. Rex und Echo, denen sich viele andere desillusionierte Klonkrieger anschlossen, begannen, gemeinsam mit ihren Gefährten gegen das Imperium vorzugehen, um gefangene Klone zu befreien und andere antiimperiale Operationen durchzuführen.

Im Jahr 18 VSY, nachdem ihre Basis auf Teth von einem imperialen Klon-X-Soldaten entdeckt worden war, wurde der Klonuntergrund in einem anschließenden Angriff der imperialen Streitkräfte weitgehend vernichtet. Rex und seine wenigen überlebenden Gefährten flohen vom Planeten, nachdem sie Klonkommandant Wolffe, der den imperialen Angriff angeführt hatte, angefleht hatten, was dieser widerwillig zuließ.

Im Jahr 19 VSY, nach der Ausführung von Befehl 66,[8] wurde der Klonuntergrund[2] von Rex als Widerstandsnetzwerk gegründet.[1] Zu den Zielen des Klonuntergrunds gehörte es, desillusionierten Klonkriegern zu helfen, dem imperialen Militär[10] zu entkommen, und im Namen der gefallenen Galaktischen Republik gegen das Imperium zu kämpfen.[11] Bis 18 VSY[12] hatte das Netzwerk mehrere Klonkontakte innerhalb des Imperiums, die als Informanten arbeiteten, wie etwa Slip bis zu dessen Tod. Die Gruppe hatte außerdem einen sympathisierenden Senator im imperialen Senat selbst, Riyo Chuchi.[10] Das Netzwerk konnte im Laufe seiner Geschichte mehrere Klone retten, darunter Gregor, Fireball, Nemec, Captain Howzer und zwei weitere Klonkrieger aus seinem Trupp.[5] Darüber hinaus schloss sich Clone Force 99-Mitglied und ehemaliger Advanced-Recon-Commando, Echo, dem Netzwerk an, nachdem die Imperial Defense Recruitment Bill verabschiedet worden war.[4] Rex hielt Kontakt mit dem Rest von Clone Force 99, zu dem Hunter, Omega, Wrecker, Tech und Crosshair gehörten, und wurde gelegentlich von ihnen unterstützt.[7]

Das Netzwerk besaß ein Schiff namens Remora, das mit einem abnehmbaren Blutegelgefäß sowie mehreren erbeuteten Rho-Klasse-Transportschuttles ausgestattet war. Der Klonuntergrund half, Klonkrieger zu retten[5] gemäß ihrer Verbundenheit als Brüder, und führte weitere Aktionen durch, die die Ausbreitung des jungen Galaktischen Imperiums behinderten. Das Versteck des Netzwerks befand sich auf dem Wilden Raum -Planeten Teth in den Ruinen eines verlassenen Klosters des B'omarr-Ordens,[7] obwohl sie auch eine Reparaturwerkstatt auf Coruscant