Yoruichi Shihouin ist das 22. Oberhaupt des Shihouin-Clans, einer der Vier Großen Adelsfamilien der Seelengesellschaft. Sie war einst Kapitänin der 2. Division des Gotei 13 und Befehlshaberin der Onmitsukidō, des verdeckten Geheimdienst- und Operationskorps der Seelengesellschaft, und beaufsichtigte dessen Elite-Attentäter und Spione.

Von Kindheit an wuchs Yoruichi zusammen mit Kisuke Urahara und Tessai Tsukabishi auf dem Anwesen der Shihouin auf und schloss eine Freundschaft, die auch in den folgenden Jahren Bestand hatte. Diese Freundschaft wurde zu einem entscheidenden Wendepunkt in ihrem Leben: Als Sōsuke Aizen Kisuke Urahara für illegale Hollowifizierungsexperimente verantwortlich machte, die in Wahrheit Aizen selbst an Shinji Hirako und mehreren anderen Shinigami durchgeführt hatte, verurteilte das Zentral-46 Urahara und Tessai dazu, ihrer Kräfte beraubt und verbannt zu werden. Yoruichi, damals noch Kapitänin der 2. Division, drang verkleidet ein und befreite die beiden persönlich aus der Haft. Anschließend half sie ihnen und den frisch hollowifizierten Shinigami (später als Visored bekannt) bei der Flucht in die Menschenwelt. Wegen ihrer Beteiligung an dem Vorfall verlor Yoruichi ihre eigene Position und ihr Ansehen in der Seelengesellschaft, und sie entschied sich, lieber mit ihren Freunden ins Exil zu gehen, statt zurückzubleiben.

Nach ihrer Verbannung ließ sich Yoruichi in der Menschenwelt nieder, arbeitete zusammen mit Kisuke Urahara und Tessai im Urahara-Laden und unterstützte im Hintergrund alle großen Konflikte, in die Ichigo Kurosaki und seine Verbündeten verwickelt waren.

Was ihre Kampffähigkeiten betrifft, ist Yoruichi als "Göttin des Blitzes" bekannt, einen Titel, den sie sich durch ihre Meisterschaft im Shunpo verdient hat. Damit zählt sie zu den schnellsten Shinigami in der Geschichte der Seelengesellschaft. Außerdem gilt sie als eine der größten Meisterinnen des Hakuda (Kampf ohne Waffen), die je existiert haben. Ihr Können ist so außergewöhnlich, dass sie ihr eigenes Zanpakutō fast vollständig ungenutzt lässt, obwohl sie Bankai erreicht hat. Allein ihre Hakuda-Fähigkeiten genügen, um Gegner auf Espada-Niveau zu besiegen, ohne überhaupt eine Waffe zu ziehen.

Darüber hinaus besitzt Yoruichi die einzigartige Fähigkeit, sich in eine schwarze Katze zu verwandeln, eine Gestalt, die sie häufig nutzt, um sich unauffällig zu bewegen, verkleidet zu bleiben oder einfach ihre Freiheit zu genießen, ohne erkannt zu werden.