Mechagodzilla war die Schöpfung der Aliens vom Planeten Schwarzes Loch 3 und das Herzstück ihrer geplanten Invasion der Erde. Die prächtige Maschine wurde aus dem Krater des Mount Fuji entlassen, trug dabei eine Godzilla-Verkleidung und machte sich auf den Weg nach Tokio, nachdem sie Anguirus erledigt hatte. Als sie Tokio erreichte, wurde der Hochstapler vom echten Godzilla angegriffen, der schnell ihr wahres Gesicht enthüllte. Mechagodzilla wurde im darauffolgenden Kampf mit Godzilla beschädigt, aber repariert und ausgesandt, um King Caesar in Okinawa zu vernichten. Godzilla kehrte zurück und half King Caesar, und gemeinsam konnten sie Mechagodzilla zerstören. Ein Jahr später wurde Mechagodzilla von den Aliens vom Planeten Schwarzes Loch 3 wieder aufgebaut und in Mechagodzilla 2 umgetauft und erneut auf Tokio losgelassen, diesmal unterstützt vom Monster Titanosaurus, das vom wahnsinnigen menschlichen Wissenschaftler Dr. Shinzo Mafune kontrolliert wurde. Godzilla erhob sich, um ein zweites Mal gegen seinen robotischen Doppelgänger zu kämpfen, sah sich jedoch zwei Gegnern deutlich unterlegen. Doch mit der Hilfe der Menschheit und dem Opfer von Katsura Mafune, der Cyborg-Tochter von Dr. Mafune, konnte Godzilla erneut triumphieren.