Die Geschichte folgt Ken Kaneki, einem College-Studenten, der eine tödliche Begegnung mit Rize Kamishiro nur knapp überlebt, seinem Date, das sich als Ghoul entpuppt. Er wird in kritischem Zustand ins Krankenhaus gebracht. Nach seiner Genesung entdeckt Kaneki, dass er sich einer Operation unterzogen hat, die ihn in einen Halb-Ghoul verwandelte. Dies gelang, weil einige von Rizes Organen in seinen Körper übertragen wurden, und nun muss er wie normale Ghoule Menschenfleisch zu sich nehmen, um zu überleben. Die Ghoule, die das Café „Anteiku“ führen, nehmen ihn auf und lehren ihn, mit seinem neuen Leben als Halb-Ghoul umzugehen. Zu seinen täglichen Kämpfen gehört es, sich in die Ghoul-Gesellschaft einzufügen und zugleich seine Identität vor seinen menschlichen Gefährten geheim zu halten, besonders vor seinem besten Freund Hideyoshi Nagachika.