Baldwin wurde 1161 als Sohn des vorherigen Königs Amalrich I. von Jerusalem und Agnes von Courtenay geboren und hatte eine recht glückliche Kindheit. Als er eines Tages mit seinen Freunden spielte und raufte, bemerkte sein Lehrer Gottfried, der Baron von Ibelin, jedoch, dass er keinen Schmerz in seinem Arm verspürte, nachdem dieser eine Schnittwunde erlitten hatte, und forschte weiter, wobei er bedauerlicherweise bei dem Kind Lepra diagnostizierte. Dies bremste Baldwin jedoch nicht, und er vollbrachte weiterhin große Dinge. Am bemerkenswertesten war sein Sieg während einer Schlacht im Alter von sechzehn Jahren. Im selben Alter unternahm er auch einen Urlaub mit seiner älteren Schwester Sibylla, eine Erinnerung, die er noch jahrelang in Ehren halten sollte.

Kurz darauf wurde er zum König von Jerusalem ernannt.