Alisa Mikhailovna Kujou (アリサ・ミハイロヴナ・九条くじょう, Arisa Mihairovuna Kujō? ; Russisch:  Алиса Михайловна Кудзё), auch bekannt als Alya(アーリャ, Ārya? ; Russisch:  Аля), ist die weibliche Hauptprotagonistin und die titelgebende Protagonistin der Serie. Sie ist eine Schülerin im ersten Jahr an der Seiren Private Academy. Alisa ist eine Vorzeigeschülerin mit den besten Noten der Schule und fungiert als Schatzmeisterin des Schülerrats. Sie gilt weithin als eines der beiden schönsten Mädchen ihres Jahrgangs, neben Yuki Suou, und ist bekannt als die Einsame Prinzessin (孤高のお姫様, Kokō no Ohimesama? ).